Introduction - De nombreuses épidémies impliquant des souches d'entérocoques résistantes aux glycopeptides (ERG) ont été rapportées en France et dans le monde. De plus, l'émergence de souches d'entérocoques résistantes au linézolide (ERL) a récemment été rapportée. L'objectif de ce travail est de décrire les principales caractéristiques des souches d'ERG et d'ERL isolées en France et reçues au Centre national de référence de la Résistance aux antibiotiques entre 2006 et 2020. Méthode - Toutes les souches reçues ont été caractérisées phénotypiquement (MALDI-TOF, antibiogramme, CMI) et génotypiquement (qPCR, WGS). Le typage et la comparaison des souches d'ERG ont été réalisés avec différentes techniques au cours du temps (électrophorèse en champ pulsé, rep-PCR, analyse génomique comparative ou spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier). Résultats - Sur les 6 311 souches d'ERG reçues sur la période 2006-2020, une très grande majorité appartenait à l'espèce E. faecium (91,8-98,3%), suivie par E. faecalis (0,8-7,9%). Le gène vanA était majoritaire (74,9%), suivi du gène vanB (23,8%). Une grande majorité (>95%) des souches d'E. faecium appartenait au complexe clonal (CC) 17. Depuis 2017, il a été observé une augmentation significative des ERL liée à la diffusion dans certaines régions de souches épidémiques présentant une résistance chromosomique, mais aussi à l'acquisition de gènes plasmidiques (notamment optrA et poxtA) par des souches non clonales. Par typage moléculaire, il a été démontré que de nombreux clones d'ERG (majoritairement E. faecium) étaient sporadiques, tandis que certains clones hyper-épidémiques (isolés chez au moins 5 patients) ont été détectés dans plusieurs établissements/villes différents avec une diffusion locorégionale. Conclusion - La majorité des souches d'ERG circulant en France sont des souches d'E. faecium adaptées à l'environnement hospitalier (CC17) et porteuses de l'opéron vanA. Il y a aussi l'émergence de souches d'ERL qui doit être surveillée étroitement.
Auteur : Zouari Asma, Auger Gabriel, Nogues Sophie, Collet Anaïs, Lecourt Maxime, Guérin François, Cattoir Vincent
Bulletin épidémiologique hebdomadaire, 2021, n°. 18-19, p. 359-364
