Le Système National des Données de Santé (SNDS) regroupe les principales bases de données médico administratives (BDMA) et de santé publique existantes en France : l'Assurance Maladie, les hôpitaux, la base des causes médicales de décès, et dans le futur les données relatives au handicap et un échantillon de données en provenance des organismes d'Assurance Maladie complémentaires. Il a pour finalité de favoriser les études, recherches ou évaluation sur les données de santé.
A l'avenir les BDMA pourraient contribuer à la surveillance des anomalies congénitales. Des études sont en cours pour estimer la fiabilité de ces bases de données et la faisabilité de leur utilisation pour la surveillance des anomalies congénitales.