La surveillance épidémiologique est primordiale pour orienter les décideurs vers les mesures de gestion adaptées aux différents contextes d'une crise sanitaire. Dans le cadre de la pandémie liée au SARS-CoV-2, une surveillance épidémiologique a été mise en place, permettant notamment d'orienter la stratégie " tester, alerter, protéger " dans le but de freiner la propagation du virus. Un système d'information de dépistage populationnel (SI-DEP) a été mis en place le 13 mai 2020 de manière très réactive, deux mois après la disponibilité des tests en mars 2020, pour recevoir systématiquement et d'une façon automatisée tous les résultats de tests (PCR, antigéniques) effectués quotidiennement par l'ensemble des laboratoires publics et privés, ainsi que les professionnels de santé habilités (France hexagonale et départements d'outre-mer). Cet article décrit l'évolution de la surveillance virologique et la mise en place de SI-DEP pendant la crise sanitaire, depuis les phases de réflexions collaboratives entre les différents acteurs impliqués, le développement du système d'information et ses évolutions, jusqu'à l'exploitation et la diffusion des données et indicateurs produits notamment par Santé publique France. Tout au long de la période de crise, plusieurs défis ont été rencontrés sur les plans scientifiques, techniques, règlementaires, ainsi que de forts enjeux de communication et de partenariats avec l'ensemble des parties prenantes. De fortes capacités d'adaptations, de cohésion et de résilience ont été nécessaires pour assurer l'ensemble des missions tout au long de cette période. SI-DEP a montré l'importance d'avoir accès aux données des laboratoires de manière réactive pour assurer une surveillance épidémiologique efficace, et déclinée aux niveaux territoriaux les plus fins.
Auteur : Durand Julien, Fayad Myriam, Feri Adeline, Truong Émilie, Taisne Benjamin, Amy Étienne, Mati Philippe, Reibel Laura, Pascal Yves, Lerpinière Achille, Beaufret Raphaël, Gauthier Bruno, Coignard Catherine, Ebel Anne, Roquebert Bénédicte, Haïm-Boukobza Stéphanie, Perez Éric, Baldé Shérif, Bernillon Pascale, Pelat Camille, Chatignoux Edouard, Bonaldi Christophe, Spaccaferri Guillaume, Arfaoui Adel, Che Didier, Caserio-Schönemann Céline, Coignard Bruno, Le Strat Yann
Bulletin épidémiologique hebdomadaire, 2024, n°. 20-21, p. 440-449
