Introduction – De nombreuses épidémies impliquant des souches d'entérocoques résistantes à la vancomycine (ERV) ont été rapportées en France et dans le monde. De plus, l'émergence de souches d'entérocoques résistantes au linézolide (ERL) a récemment été décrite. L'objectif de ce travail est de décrire les principales caractéristiques des souches d'ERV et d'ERL isolées en France et reçues au Centre national de référence de la résistance aux antibiotiques entre 2006 et 2022. Méthode – Toutes les souches reçues ont été caractérisées phénotypiquement (MALDI-TOF, antibiogramme, concentration minimale inhibitrice – CMI) et génotypiquement (PCR en temps réel, séquençage complet du génome). Le typage et la comparaison des souches d'ERV ont été réalisés avec différentes techniques au cours du temps (électrophorèse en champ pulsé, rep-PCR, analyse génomique comparative ou spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier). Résultats – Sur les 7 416 souches d'ERV reçues sur la période 2006-2022, une très grande majorité appartenait à l'espèce Enterococcus faecium (91,8-98,8%), suivie par E. faecalis (0,8-7,9%). Le gène vanA était majoritaire (76,5%), suivi du gène vanB (22,2%). La quasi-totalité des souches d'E. faecium (>95%) appartenaient au complexe clonal (CC) 17. Depuis 2017, il a été observé une augmentation significative des ERL liée à la diffusion dans certaines régions de souches épidémiques présentant une résistance chromosomique, mais aussi à l'acquisition de gènes plasmidiques (notamment optrA et poxtA) par des souches non clonales. Par typage moléculaire, il a été démontré que de nombreux clones d'ERV (majoritairement E. faecium) étaient sporadiques tandis que certains clones hyperépidémiques (isolés chez ≥5 patients) ont été détectés dans plusieurs établissements/ villes différents avec une diffusion locorégionale. Conclusion – La majorité des souches d'ERV circulant en France sont des souches d'E. faecium adaptées à l'environnement hospitalier (CC17) et porteuses de l'opéron vanA. Il y a aussi une émergence alarmante des souches d'ERL qui doit être étroitement surveillée.
Auteur : Zouari Asma, Auger Gabriel, Nogues Sophie, Collet Anaïs, Lecourt Maxime, Guérin François, Cattoir Vincent
Bulletin épidémiologique hebdomadaire, 2023, n°. 22-23, p. 473-480
