Point épidémiologique COVID-19 du 19 mai 2022 : les indicateurs poursuivent leur amélioration au niveau national ; la circulation du SARS-CoV-2 continue de s’intensifier en Martinique

En semaine 19 (du 09 au 15 mai 2022), l’ensemble des indicateurs épidémiologiques continuait de s’améliorer avec une diminution des taux d’incidence et de positivité dans l’ensemble des classes d’âge et des régions métropolitaines. À l’hôpital, le nombre d’admissions diminuait toujours, de même que le nombre d’admissions en services de soins critiques. En Outre-mer, l’évolution des indicateurs était plus hétérogène avec notamment une augmentation importante de la circulation du SARS-CoV-2 en Martinique, où le taux d’incidence s’élevait à 1 367 cas pour 100 000 habitants. Le 16 mai, seuls 34,8% des 60-79 ans éligibles et 25,5% des 80 ans et plus éligibles avaient reçu leur seconde dose de rappel. Dans le contexte d’une circulation du SARS-CoV-2 et des virus grippaux en décroissance mais toujours présente, le respect de l’application des mesures barrières reste nécessaire pour continuer à améliorer la situation épidémique. De plus, l’effort de vaccination doit se poursuivre, notamment dans les territoires actuellement touchés par la recrudescence de la COVID-19, ainsi que pour la deuxième dose de rappel chez les éligibles, dont les plus âgés
et les immunodéprimés. Le suivi des autres mesures préconisées reste également nécessaire en cas de symptôme, de test positif ou de contact à risque. 

Poursuite de la diminution des taux d’incidence, de dépistage et de positivité

Au niveau national, le taux d’incidence diminuait toujours en semaine 19, passant à 332 cas pour 100 000 habitants (-18% par rapport à la semaine 18), tout comme les taux de dépistage (1 901, -5%) et de positivité, ce dernier passant sous les 20% (17,5%, -2,7 points). Ces baisses s’observaient dans toutes les classes d’âge, à l’exception du taux de dépistage qui augmentait de 11% chez les 0-9 ans et qui était stable chez les 10-19 ans, probablement en lien avec la rentrée scolaire de la zone C. Les données par tranche d’âge correspondant aux niveaux scolaires montraient d’ailleurs
une stabilité du taux d’incidence uniquement chez les 6-14 ans. Le taux d’incidence était le plus élevé chez les 30-39 ans (400, -17%) et les 70-79 ans (387, -23%). 

En France métropolitaine, les taux d’incidence et de positivité étaient en baisse dans toutes les régions. Les taux d’incidence pour 100 000 habitants allaient de 398 en Bretagne à 232 en Île-de-France. Les taux de dépistage diminuaient dans toutes les régions à l’exception de l’Île-de-France (2 142, +3%), où il était parmi les plus élevés avec la Provence-Alpes-Côte d’Azur (2 365, -7%). En Outre-mer, le taux d’incidence était toujours en forte hausse en Martinique, atteignant un niveau très élevé (1 367, +45%), sans impact pour le moment sur les indicateurs hospitaliers. Le taux d’incidence restait stable à un niveau élevé en Guadeloupe et ce depuis plusieurs semaines (736, +7%). La situation s’améliorait pour la troisième semaine consécutive à La Réunion (663, -31%).

Les nouvelles hospitalisations et admissions en soins critiques toujours en baisse 

Au niveau national, le nombre de nouvelles hospitalisations et d’admissions en soins critiques étaient toujours en baisse (respectivement 4 074, -25% et 442, -24%). Le nombre de décès à l’hôpital et en ESMS s’élevait à 513 (-18%, données non consolidées). L’excès modéré de la mortalité toutes causes observé entre les semaines 12 et 17 semblait revenir dans les marges de fluctuation habituelle en semaine 18.

En France métropolitaine, le taux de nouvelles hospitalisations diminuaient et passaient sous le seuil des 10 pour 100 000 habitants dans l’ensemble des régions. Les taux de nouvelles admissions en soins critiques étaient stables en Nouvelle-Aquitaine et Centre-Val de Loire, et diminuaient dans les autres régions. En Outre-mer, le taux de nouvelles hospitalisations restait le plus élevé mais en diminution à La Réunion.

Le sous-lignage BA.2 d’Omicron reste majoritaire

Les données de séquençage confirment l’omniprésence d’Omicron en France. En métropole, il représentait 100% des séquences interprétables des enquêtes Flash S17 (25/04) et Flash S18 (02/05). Dans les DROM, Omicron est le seul variant détecté depuis Flash S06 (07/02).

Le sous-lignage BA.2 est majoritaire en France, avec 98,7% des 1 764 séquences interprétables de l’enquête Flash S18 (02/05). Les sous-lignages d’Omicron BA.4 et BA.5 font l’objet d’une surveillance renforcée, et sont détectés en France depuis Flash S13 (28/03) pour BA.5 et Flash S16 (19/04) pour BA.4. La détection de BA.4 et BA.5 au cours des enquêtes Flash est toujours faible mais en légère augmentation : 0,3% pour BA.4 et 0,5% pour BA.5 au cours de Flash S18, contre 0,1% pour BA.4 et 0,3% pour BA.5 au cours de Flash S17. Les résultats de criblage C1 montrent que la
proportion de détection de la mutation L452R, qui était présente majoritairement chez Delta, continue d’augmenter, passant de 0,8% en semaine 18 à 1,8% en semaine 19. Cette mutation est retrouvée chez les sous-lignages d’Omicron BA.4 et BA.5, mais aussi chez d’autres sous-lignages de BA.1 et BA.2 (dont BA.2.11). Cette augmentation des prélèvements criblés C1 correspond à des résultats de criblage C1D1, ce qui confirme qu’il s’agit de sous-lignages d’Omicron porteurs de L452R et non d’une résurgence de Delta. D’autre part, le recombinant XD détecté à des niveaux faibles depuis début janvier 2022, n’a pas été détecté au cours de Flash S17 et Flash S18. 

• Plus d’informations sont disponibles dans l’analyse de risque variants du 20/04/2022.

Plus de 18% des 80 ans et plus ont reçu une seconde dose de rappel

Au 16 mai 2022, l’estimation de la couverture vaccinale en population générale était de 79,7% pour une primovaccination complète et de 59,3% pour la dose de rappel. La couverture vaccinale de la dose de rappel était 74,1% chez les 18 ans et plus et de 84,0% chez les 65 ans et plus. En outre, 9,7% des enfants âgés de 10 à 11 ans avaient reçu une première dose de vaccin (3,2% pour les 5 à 9 ans). Parmi les 60-79 ans, 5,3% avaient reçu une seconde dose de rappel (4,5% au 09/05/2022) et 34,8% de ceux qui y étaient éligibles l’avaient effectivement reçue. Parmi les 80 ans et plus, la couverture vaccinale de cette seconde dose était de 18,1% (16,7% au 09/05/2022), et 25,5% de ceux qui étaient éligibles à cette date l’avaient reçue.

Les données de couvertures vaccinales par département, et celles concernant la deuxième dose de rappel dans toutes
les classes d’âge et chez les résidents en Ehpad ou USLD sont publiées sur Géodes.